Kampus Induk

1. Pejabat Pendaftar
   a)  Kluster Kepimpinan USM
   b)  Unit Kajian Dasar & Penyampaian Perkhidmatan
   c)  Unit Perkhidmatan Kemudahan Pusat
   d)  Bahagian Pengurusan Maklumat & ICT
   
   
2. Bahagian Sumber Manusia
   a)  Pejabat Timbalan Pendaftar Kanan
   b)  Unit Pengambilan Staf (UAS)
   c)  Unit Perkhidmatan & Saraan (UPS)
   d)  Unit Pembangunan Organisasi (UPO)
   e)  Unit Kemajuan Kerjaya (UKK)
   f)  Unit Pembangunan Staf (UBS)
   g)  Unit Pentadbiran & Kewangan (UPK)
   h)  Unit Perhubungan Staf (UPHS)
   
   
3. Bahagian Pengurusan Akademik
   a)  Unit Senat
   b)  Unit Pengambilan Pelajar
   c)  Unit Peperiksaan & Pengijazahan
   d)  Unit Rekod Pelajar
   
   
4. Pusat Transformasi Insan
   
   
5. Seksyen Pengurusan IPPT

Kampus Kejuruteraan

1. Bahagian Pengurusan Sumber Manusia
2. Bahagian Pengurusan Akademik

Kampus Kesihatan

1. Pejabat Timbalan Pendaftar Kanan
2. Unit Perkhidmatan & Pembangunan Organisasi
3. Unit Pengambilan & Pembangunan Staf
4. Unit Pentadbiran & Perhubungan Staf
5. Unit Pengurusan Akademik
6. Pusat Transformasi Insan
7. Unit Pengurusan Siswazah & Antarabangsa (IPS & IMCC)